1589 Gründung durch Caspar Bauhin, damit einer der ältesten Botanischen Gärten der Welt.

1692 Verlegung zur Predigerkirche (heute Klinikum 2, Petersgraben 6)
1700 eigenes Gärtnerhaus (Baubeginn)
1776 Werner de Lachenal, Professor für Anatomie und Botanik (bis 1798)
1777 Lachenal stiftet ein neues Gebäude für Professor und Gärtner
1795 Ankauf eines (gebrauchten) Treibhauses aus einem Privatgarten
1800 Tod Lachenals. K. F. Hagenbach übernimmt die Nachfolge
1822 Trennung von Anatomie und Botanik
1835 Gründung der Botanischen Kommission
1837 Erstes gedrucktes Samenverzeichnis (Index seminum) mit über 600 Arten

1838/40 Verlegung vors Aeschentor. Holzgewächshäuser
1844 Glashaus für Orchideen und Farne
1862 Aufstockung des Jahresetats. Vollangestellter Gärtner
1863 neue Metall-Gewächshäuser; blühende Victoria regia
1867 Neubau der Gärtnerwohnung
1870 Peter Merian stiftet die Büste Werner de Lachenals
1891 erste thematische Veranstaltung: Ausstellung mit Kürbisfrüchten
1892 kleine Kakteenausstellung

1898 Verlegung zum Spalentor (Eröffnung am 12.-14. Juli)
1921 Umänderung des Freilandes
1943 Gartenführer von G. Senn (bleibt als Manuskript liegen)
1949 Sabal umbraculifera stösst im Palmenhaus an die Decke und muss gefällt werden
1951 Der Obergärtner wird pensioniert. Stelle vakant bis 1967
1962 neue Anzuchtgewächshäuser
1967 Neubau des Tropenhauses
1978 Gesneriaceae-Ausstellung
1989 400jähriges Jubiläum • Veranstaltungszyklus• Gartenbroschüre • Tropenhaus-Führer
1990 von nun an jedes Jahr öffentliche Veranstaltungen und zahlreiche Führungen
1996 Neubau von Viktoriahaus, Kalthaus und Sukkulentenhaus
1998 Gründung des «Vereins Botanischer Garten»
2003 neue Anzuchtgewächshäuser
2004 Petition gegen die Abtrennung von der Universität